En el año transcurrido desde que los suplentes de la 77ª generación se unieron a AKB0048, la Organización de Comercio de la Galaxia Profunda [DGTO] y DES han intensificado sus ataques contra el entretenimiento. En respuesta, AKB0048 recupera las elecciones generales y la posición de nova central. Los suplentes son ahora empujados a una nueva competencia directamente contra los sucesores. Pero mientras AKB0048 recupera políticas que no se veían desde la desaparición de Acchan, un nuevo enemigo más poderoso se mueve silenciosamente entre bastidores.