Ha pasado un siglo desde que la magia -la verdadera magia, la materia de las leyendas- volvió al mundo. Es primavera, la estación de los nuevos comienzos, y una nueva clase de estudiantes está a punto de comenzar sus estudios en la Primera Escuela Secundaria Afiliada a la Universidad Mágica Nacional, apodada: Primera Escuela Secundaria. Mahouka Koukou no Yuutousei (La alumna de honor del instituto de magia) es un manga derivado de la popular serie de novelas ligeras Mahouka Koukou no Rettousei (La alumna de honor del instituto de magia) que sigue los acontecimientos de la serie original a través de los ojos de Miyuki Shiba, la hermana de Tatsuya. La vida de un estudiante de honor viene con un montón de expectativas... y sentimientos ocultos inesperados...