Después de la muerte de sus padres, Yuuto Amakawa vive una vida bastante normal en la ciudad. El único problema del que se tiene que preocupar mientras asiste a la escuela junto a Rinko, su vecino de al lado, es su alergia a los gatos. Todo eso cambia cuando cumple dieciséis años, cuando un Ayakashi, una criatura sobrenatural, lo ataca por los pecados de sus antepasados. Afortunadamente, es salvado por Himari, una misteriosa gatúbela con una espada, que explica que Yuuto es el vástago de una familia de asesinos de demonios, y que ella está ahí para protegerlo ahora que el encanto que lo mantenía oculto de las fuerzas sobrenaturales del mundo ha perdido su poder. Omamori Himari relata el trato de Yuuto con las diversas fuerzas del mundo sobrenatural, así como el creciente número de mujeres que se presentan en su puerta, cada una con sus propios y oscuros deseos. ¿Será Yuuto capaz de adaptarse a su nuevo entorno "excitante"? ¿O el fantasma de su pasado (de sus antepasados) lo alcanzará?