El alegre Yuuki Cross y el rudo Zero Kiryuu son miembros del comité disciplinario de la Academia Cross, que alberga dos clases muy distintas: la clase diurna y la clase nocturna. Su trabajo consiste en mantener el orden entre las clases cuando se cambian. Aunque no parezca una tarea especialmente difícil, la clase diurna no sabe la verdad que hay detrás de la clase nocturna: sus magníficos estudiantes son vampiros. Hace diez años, Yuuki fue salvada de un ataque de vampiros por Kaname Kuran, un vampiro de sangre pura. Ahora, Kaname es el líder de la Clase Nocturna, y el puesto en el comité disciplinario de Yuuki le permite volver a verlo, haciendo que sus sentimientos por él se compliquen. Mientras tanto, Zero siente un odio feroz hacia todos los vampiros y cree que nunca podrán vivir en armonía con los humanos. Pero un secreto del pasado de Zero pronto amenaza la frágil paz de todos en la academia, y puede que las cosas nunca vuelvan a ser iguales.